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          生物信息學(Bioinformatics)是在生命科學的研究中,以計算機為工具對生物信息進行儲存、檢索和分析的科學。其研究重點主要體現在基因組學(Genomics)和蛋白質組學(Proteomics)兩方面,具體說就是從核酸和蛋白質序列出發,分析序列中表達的結構功能的生物信息。

          主要應用軟件為:

          BARRACUDA,CUDASW++,CUSHAW,NVBIO,NVBowtie,PEANUT,REANUT,REACTA,SeqNFind,SOAP3,UGENE,WIDELM,Materials Studio等 

          聯眾集群高性能計算解決方案 

          1.采用四路E5-4600V2系列(主頻高于2.5GHZ4U超算平臺,其適用于分子動力學應用,實現大規模并行

          2.搭配采用GPU計算平臺,NVIDIA TESLA K80/K40系列高性能計算卡,單機能容納4GPU卡,CUDA核心數能達到19968核心

          3.存儲系統采用,多臺72盤位大容量存儲,單機容量達到288T;因為I/O壓力比較大,因此存儲讀寫性能要求快;同時數據量非常大

          4.集群計算網絡采用Infiniband FDR(56GB),管理網絡采用萬兆網絡

          5.管理及其應用軟件,根據用戶需求安裝系統及搭建使用環境,軟件環境包括基于Linux核心開發的操作及管理系統,提供MPI并行環境的搭建,GCC系列編譯器,C,C++,fortran,java 等,并優化科學計算庫BLAS/ATLAS/Lapack/ScalaPack/FFTW等以及源代碼開放的計算與模擬軟件等,高級工程師優化PBS作業管理與作業調度系統,依據用戶的要求編寫相關腳本。

          6.聯眾集群所有節點采用80PLUS高效(96%)電源,提高電源轉換效率,降低用戶運維成本。結合集群管理監控軟件,自動將空閑資源設置為待機或者關機狀態,整體節能降低20%

                聯眾集群結合用戶實際應用需求,幫助用戶解決其應用難題,節約科研經費,這是我們一貫的工作態度

                詳情致電:400-630-7530

                E-MAIL  :xiejin@linzol.com

           
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